Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rpusd2Q149F1 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd2Q149F1 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Rpusd2Q149F1 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Rpusd2Q149F1 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd2Q149F1 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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