Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Cntn3Q07409 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Cntn3Q07409 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Cntn3Q07409 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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Cntn3Q07409 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Cntn3Q07409 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Cntn3Q07409 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms