Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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Sh3bp2Q06649 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp2Q06649 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms