Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms