Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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Sh3bp1P55194 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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Sh3bp1P55194 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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Sh3bp1P55194 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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Sh3bp1P55194 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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Sh3bp1P55194 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms