Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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