Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd10P28359 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms