Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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