Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccl20O89093 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ccl20O89093 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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