Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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