Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Trav12-2A0N8N6 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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