Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col4a3Q9QZS0 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms