Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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Cldn12Q9ET43 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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Cldn12Q9ET43 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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Cldn12Q9ET43 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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Cldn12Q9ET43 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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Cldn12Q9ET43 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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Cldn12Q9ET43 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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Cldn12Q9ET43 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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Cldn12Q9ET43 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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Cldn12Q9ET43 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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Cldn12Q9ET43 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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Cldn12Q9ET43 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn12Q9ET43 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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