Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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