Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms