Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Rnf40Q3U319 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Rnf40Q3U319 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Rnf40Q3U319 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Rnf40Q3U319 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Rnf40Q3U319 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Rnf40Q3U319 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Rnf40Q3U319 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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Rnf40Q3U319 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Rnf40Q3U319 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms