Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn18P56857 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms