Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sh3bp1P55194 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sh3bp1P55194 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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