Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms