Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ggta1P23336 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms