Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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