Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms