Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col4a3Q9QZS0 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
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