Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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