Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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