Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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Ccdc88cQ6VGS5 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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Ccdc88cQ6VGS5 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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Ccdc88cQ6VGS5 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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Ccdc88cQ6VGS5 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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Ccdc88cQ6VGS5 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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