Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Pdzrn3Q69ZS0 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms