Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Rnf40Q3U319 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Rnf40Q3U319 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Rnf40Q3U319 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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Rnf40Q3U319 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf40Q3U319 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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