Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Cntn3Q07409 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Cntn3Q07409 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Cntn3Q07409 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Cntn3Q07409 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Cntn3Q07409 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Cntn3Q07409 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Cntn3Q07409 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cntn3Q07409 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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