Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms