Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms