Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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