Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Gm21818J3KMS6 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Gm21818J3KMS6 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Gm21818J3KMS6 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms