Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
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