Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc9bA3KGF9 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms