Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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