Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hdac6Q9Z2V5 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms