Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn13Q9Z0S4 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms