Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rdh11Q9QYF1 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms