Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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