Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc3Q9D6Y1 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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