Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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