Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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Smg8Q8VE18 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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Smg8Q8VE18 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Smg8Q8VE18 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Smg8Q8VE18 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Smg8Q8VE18 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Smg8Q8VE18 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Smg8Q8VE18 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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