Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms