Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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NipblQ6KCD5 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NipblQ6KCD5 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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