Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cpne9Q1RLL3 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms