Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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