Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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