Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms