Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SbdsP70122 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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